西雅圖--(美國商業資訊)--美國華盛頓州西雅圖的系統生物學研究所 (ISB) 與瑞士蘇黎世的瑞士聯邦工學院 (ETH 蘇黎世) 今天在澳洲雪梨召開的人類蛋白質組組織 (HUPO) 第9屆世界年會上宣佈，他們已透過質譜分析完成了人類蛋白質組完整圖譜第一階段的繪製。這些資料將作為ISB/ETH PeptideAtlas (www.peptideatlas.org) 計畫的一部分，透過ISB/ETH SRMAtlas資料庫 (www.srmatlas.org) 供研究人員調閱。

人類基因組中，為蛋白質編碼的基因目前已標明的有20,300個，據研究小組報導，他們已為這每一個基因產生了黃金標準（gold standard）參照質譜譜系。該參照圖譜可讓研究人員採用諸如選擇反應監測掃描 (SRM) 這樣的標靶質譜技術來檢測和定量任何生物學樣本中的任何人類蛋白質，並能使他們更迅速更可靠地分析經典的Discovery質譜技術所產生的資料。Robert Moritz, Ph.D. 副教授 (ISB)、Leroy Hood, M.D., Ph.D. 教授 (ISB) 和 Ruedi Aebersold, Ph.D. 教授 (ETH) 協同他們的團隊和合作夥伴已進行了150,000多次SRM (選擇反應監測掃描) 檢測，包括每種蛋白質至少5個蛋白特異 (蛋白質特有的) 肽每個均檢測一次。此外，他們還針對所有膜蛋白質和幾乎所有可能包含碳水化合物 (透過N糖基化位點結合) 的蛋白質進行了SRM檢測。他們還將檢測擴展至人類群體發生率大於30%的基因DNA編碼單字母改變 (即單核苷酸多樣性或簡稱SNP) 所致突變中的大部分，這些突變導致氨基酸的改變。這些檢測彙總起來組成了人類蛋白質組研究中迄今最全面的公開資源。

人類基因組計畫最基礎的貢獻之一是使所有的生物學家能夠調閱所有的人類基因；這一人類蛋白質組計畫最終將同樣能夠使所有的生物學家調閱所有的人類蛋白質。

Robert Moritz為首的ISB團隊已經與Ruedi Aebersold和他的ETH團隊合作開發了工作流程。Ruedi Aebersold是ISB的聯合創辦人，他也是瑞士聯邦工學院 (ETH 蘇黎世) 的系統生物學教授，與ISB主席Lee Hood 共同擔任SRM圖譜計畫的聯合主要研究者。Aebersold博士是建立公開資源以支援人類蛋白質組質譜研究的先驅。

依據2009年《美國復甦與再投資法案》（American Recovery and Reinvestment Act），美國國立衛生研究院下屬國立人類基因組研究所為ISB提供了270萬美元的直接資助，以支援這項計畫。ERC蛋白組學先進經費v3.o 233226號資助經費為ETH提供了為期5年總計240萬歐元的計畫支援。

該計畫還得到了Agilent Technologies公司和AB/SCIEX 公司這2家領先技術公司的支援，他們分別為ISB和 ETH 蘇黎世提供儀器支援，Thermo-Fisher公司和JPT公司提供肽耗材，生物耗材公司OriGene公司提供純化的人類蛋白質。

完整的人類蛋白質組圖譜和S/MRM圖譜將為研究人員檢測和定量任何生物學樣本中的任何人類蛋白質提供一整套資訊和檢測方法。這項重大發展將大幅提高蛋白組學研究的可重複性和可靠性，從而顯著加速基礎研究和轉化研究。透過發掘Aebersold教授於2003年繪製的10,000種已知人類蛋白質ISB肽圖譜，並將這些資訊補充到ISB研究人員及其合作者採用生物資訊學分析法開發的其餘人類蛋白質的肽預測演算法中，該團隊已經能夠在沒有實體資料的情況下推衍出供SRM用途的最佳蛋白特異肽。全套圖譜包括每種蛋白質的至少5個肽。此外，這些工具還能夠使研究人員挑選最佳的肽轉換，以便在複雜的混合物中獨一無二地辨識這些肽。

圖譜將透過SRMAtlas網站發佈，該計畫的所有資訊將公開。

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